tsubameでgfarmコマンドが使えません。

TSUBAME(login-t2.g.gsic.titech.ac.jp)に直接ログインしていないでしょうか。
HPCI関係のコマンドを使用する場合は、
hpci-login.g.gsic.titech.ac.jp
にログインをお願いいたします。

TSUBAMEにおけるHPCIの利用については、 こちら を参照していただくと共に、
HPCIに関するマニュアルなども参照いただけますと幸いです。